石门内。
小智放眼望去，看到整个密室都放置着一堆铁制的忍者武器和一些财宝进化石等，其中心位置的石台上放着一个木盒子。
“破铜烂铁还真够多。”全身散浮起黑烟的耿鬼，从地上浮起，飞向那些忍者武器。
“手脚不要太多，这不是我们的，也对我们没什么用处，我们的重点是这个盒子里的东西，所以其它禁止碰。”
小智拿起盒子，探查里面，以防有什么机关，最终，他忽然眉开眼笑了起来，这么看来，说明里面的东西是他要的。
轰！！
在小智刚要打开盒子时，上方猛然震动掉落灰尘。
“这气息是黑化。”小智眼中闪过寒光，他最讨厌，有人经常找他麻烦。
按小智以往的经历，只要他在的地方，就有黑化精灵和联盟的人。
“大开杀戒了！”耿鬼的身形大变，如嗜血魔鬼，飞进上方。
“心正不爽，我就拿你们出气！”小智拿起盒子冲向上方。
地面上。
忍者村的人，正指挥着精灵对战面前的黑化精灵和指挥黑化精灵的人类。
此刻，地面已经沾满了精灵和人类被杀死后所流出的血液，一堆堆残肢败体，如同没有墓碑的坟场，令在场的一些忍者的内心滋生惧念。
同时，小刚他们也卷入了这场血腥战斗，幸亏他们身上也有实力较强的精灵，暂且没有危险。
在此时，小智已经出来了，接着他叫出全部精灵战斗，自己则去边保护紫柔和莎莉娜，边厮杀袭来的敌人。
这种时候，小智可不会留情放黑化精灵一命，虽然它们没彻底黑化，但当前的情况，是不准小智这么做，并且这种黑化精灵像源源不断的河流，没完没了，怎么杀也杀不光。
问题就出在上方的数艘飞船，这些飞船一直跳落下黑化精灵和人。
“黑暗进化！”蓦然敌方有一些人举起手，露出环绕邪气的手环，大喊道。
这次联盟有备而来，真的要拿出全部的实力。
小智的战意一瞬间爆发，手环轮耀起七彩光辉，“超进化！”
当即喷火龙它们四个的超进化石射出独特的光辉，流进它们的体内，最终，形成超进化形态！
局势因此好转了些，那些怪物化的黑化精灵都交由它们四个对付，当然也有人协助。
“呱头！”本在激战的呱头蛙，突然被偷袭，以致受到重创，吐出蓝色鲜血，倒在了小山边。
“呱头蛙，小心！”感应到自己的精灵受伤，小智凝望而去，脸色随即变得惊慌，他看见有精灵冲向了呱头蛙。
“呱头！”拼尽最后力量的呱头蛙，借由临危而出的激流特性，将力量提升了几倍，使出了急冻光线，冰冻住了袭来的精灵。
但是，它却没注意有一轮攻击攻向了它，这小智却发现了，不过由于距离较远又要防备攻击保护两女，他已经来不及去救呱头蛙。
“呱头。”被击中的呱头蛙，吐了一大口鲜血，生命气息正慢慢削弱。
“不！”清楚感觉到呱头蛙快临死了，小智愤怒咆哮起，身上覆盖起一层彩光，直冲而去，但是又有一道攻击袭向了呱头蛙，速度已经慢了。
突然在这时，小智的衣袋里飞出一颗深蓝刺眼的珠子，以光速般的速度，融进了呱头蛙的体内，攻击也在下一息间，吞没了呱头蛙的身躯。
在那一刻，小智的表情变得灰暗，就像被一道晴天霹雳给轰中一样，面如死灰。
这一幕皮卡丘它们也看见了，它们的表情和小智一样，那么深暗，也因此恨自己怎么不去帮忙。
当攻击散去时，那里只有一团巨大的蓝光存在，还有几道大海翻腾的声音……吸引气全部人的注意力。
呱头蛙没死！小智喜极哭泣，如果呱头蛙死了，他一定会当场发疯。
“这一定是水灵法珠救了呱头蛙一命，否则没有其它可能。”从蓝光中嗅到刚才那颗融进呱头蛙体内的气息，小智就判定水灵法珠在千钧一发之际，救了呱头蛙一命，还……
“蛙头！”蓝光以迅疾的速度，化为水流，包围住了呱头蛙的身体。
阵阵更深蓝的光辉再一次辉耀，使其形体发生了改变，随着一股如海啸的磅礴气势震住了再场的所有人和精灵，令他们仿佛置身于深海中。
气势散去之时，蓝光溃散在天地间，一只神情冷傲的甲贺忍蛙站在了那里，它的双眼如锋刃，气势无比凌人，致使大量敌人向它蜂拥而去。